История создания фонда начиналась в 2013 году. В этом году люди, впоследствии ставшие учредителями и попечителями фонда, провели в городе Севастополе первое совместное церковно-общественные мероприятия “Исход”, посвящённое трагедии эвакуации Русской Белой армии и беженцев из портов Крыма в 1920 году в ходе Гражданской войны в России.

В дальнейшем, количество и масштаб различных мероприятий увеличивался, росло и число соратников не равнодушных к истории отечества и состоянию общества в современной России. Было принято решение о создании благотворительного фонда.

Благотворительный фонд «Херсонесская купель» по сохранению духовно-культурного наследия, создан по решению Общего собрания учредителей 15 марта 2021 года. Собрание прошло в конференц-зале Свято-Владимирского собора в Херсонесе.